MSProt es un completo programa con el que podrás visualizar de forma fácil y cómoda todo tipo de estructuras proteicas. Para ello solo deberás arrancar la aplicación y cargar un archivo con extensión PDB que contenga todos los datos.

A través de numerosos accesos directos desde el menú, tendrás la posibilidad de ver los tipos, átomos, aminoácidos, y posiciones en el eje XYZ de cada una de las pequeñas partes que componen la molécula final.

En la zona superior de la ventana de MSProt es posible ver una representación en 3 dimensiones de la estructura proteica, mientras que en la parte inferior aparece una tabla con numerosos datos e información.